Sastavljanje prototipa na štampanoj ploči (PCB) gotovo je identično sastavljanju punog ciklusa PCB-a, s tim da je najveća razlika u broju PCB-a koji se koriste. Mnogi dijelovi proizvode toplinu u PCB-u, pa bi izumitelj trebao slušati upute proizvođača o razmaku dijelova u sklopu prototipa PCB-a. Većina PCB-ova je napravljena da ispune određeni zadatak, a optimiziranje PCB-a za taj zadatak može ojačati prototip. Prilikom izvođenja montaže prototipa PCB-a, najbolje je ostaviti malo prostora oko ivice iz bezbednosnih razloga. Neki dijelovi u PCB-u moraju biti postavljeni u određeno područje, a može biti lakše prvo postaviti te dijelove.
Iako je prototipna PCB ona koja nije na tržištu, općenito postoji mnogo komercijalno dostupnih dijelova koji se koriste za sastavljanje prototipa PCB. Mnogi od tih dijelova dolaze s uputama proizvođača koje upućuju na to koliko dijelovi trebaju biti udaljeni jedan od drugog kako bi se osiguralo da toplina stvorena od svakog dijela ne uništava komponente u blizini. Obično je najbolje to pratiti tokom sastavljanja prototipa PCB; u suprotnom, ploča može imati vrlo kratak vijek trajanja.
